MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 2185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187078	TCG	2	6	61	66	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NT_187078	CCG	2	6	194	199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NT_187078	CTT	2	6	221	226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NT_187078	TTGT	2	8	252	259	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187078	TTG	2	6	309	314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187078	CTG	2	6	330	335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NT_187078	T	6	6	448	453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187078	GCC	2	6	520	525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NT_187078	TGA	2	6	550	555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187078	TTC	2	6	556	561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NT_187078	CCT	2	6	574	579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NT_187078	ATT	2	6	597	602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187078	ACCC	2	8	694	701	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NT_187078	TTGCT	2	10	729	738	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NT_187078	GCC	2	6	844	849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NT_187078	AG	3	6	867	872	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187078	TA	3	6	908	913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187078	AT	4	8	923	930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187078	T	6	6	1019	1024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187078	T	6	6	1042	1047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187078	TAA	2	6	1052	1057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187078	TGT	2	6	1076	1081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187078	AT	3	6	1124	1129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187078	TAT	2	6	1140	1145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249100
25	NT_187078	TCG	2	6	1270	1275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249100
26	NT_187078	CA	3	6	1341	1346	50 %	0 %	0 %	50 %	409249100
27	NT_187078	CGC	2	6	1363	1368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249100
28	NT_187078	TCG	2	6	1445	1450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249100
29	NT_187078	CCG	2	6	1457	1462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249100
30	NT_187078	GCG	2	6	1469	1474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249100
31	NT_187078	GGT	2	6	1477	1482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249100
32	NT_187078	AATG	2	8	1537	1544	50 %	25 %	25 %	0 %	409249100
33	NT_187078	TAT	2	6	1603	1608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249100
34	NT_187078	GCT	2	6	1686	1691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249100
35	NT_187078	TGA	2	6	1719	1724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249100
36	NT_187078	ATG	2	6	1738	1743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249100
37	NT_187078	AGG	2	6	1832	1837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249100
38	NT_187078	CCA	2	6	1882	1887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249101
39	NT_187078	GCT	2	6	1922	1927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249101
40	NT_187078	GGT	2	6	2024	2029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249101
41	NT_187078	GA	3	6	2068	2073	50 %	0 %	50 %	0 %	409249101
42	NT_187078	GC	3	6	2178	2183	0 %	0 %	50 %	50 %	409249101
43	NT_187078	GAG	2	6	2283	2288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249101
44	NT_187078	CCG	2	6	2370	2375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249101
45	NT_187078	ATG	2	6	2404	2409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249101
46	NT_187078	CT	3	6	2437	2442	0 %	50 %	0 %	50 %	409249101
47	NT_187078	GCT	2	6	2552	2557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249101
48	NT_187078	TTA	2	6	2609	2614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249101
49	NT_187078	CTG	2	6	2655	2660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249101
50	NT_187078	GTG	2	6	2678	2683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249101
51	NT_187078	TGC	2	6	2716	2721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249101
52	NT_187078	GCC	2	6	2728	2733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249101
53	NT_187078	GCT	2	6	2756	2761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249101
54	NT_187078	GCT	2	6	2810	2815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249101
55	NT_187078	GCG	2	6	2872	2877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249101
56	NT_187078	CGC	2	6	2884	2889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249101
57	NT_187078	GCG	2	6	2909	2914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249101
58	NT_187078	TGAG	2	8	2938	2945	25 %	25 %	50 %	0 %	409249101
59	NT_187078	TGT	2	6	2971	2976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249101
60	NT_187078	GAG	2	6	3006	3011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249101
61	NT_187078	GGGC	2	8	3102	3109	0 %	0 %	75 %	25 %	409249101
62	NT_187078	GAC	2	6	3161	3166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249101
63	NT_187078	GGA	2	6	3185	3190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249101
64	NT_187078	GGC	3	9	3195	3203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249101
65	NT_187078	GAT	2	6	3218	3223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249101
66	NT_187078	TATT	2	8	3235	3242	25 %	75 %	0 %	0 %	409249101
67	NT_187078	GAA	2	6	3302	3307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249102
68	NT_187078	AC	3	6	3410	3415	50 %	0 %	0 %	50 %	409249102
69	NT_187078	TC	3	6	3421	3426	0 %	50 %	0 %	50 %	409249102
70	NT_187078	GACG	2	8	3481	3488	25 %	0 %	50 %	25 %	409249102
71	NT_187078	TTG	2	6	3603	3608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249102
72	NT_187078	TGC	2	6	3623	3628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249102
73	NT_187078	GGC	2	6	3635	3640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249102
74	NT_187078	ACG	2	6	3765	3770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249102
75	NT_187078	GCC	2	6	3788	3793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249102
76	NT_187078	ACG	2	6	3864	3869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249102
77	NT_187078	GC	3	6	3876	3881	0 %	0 %	50 %	50 %	409249102
78	NT_187078	AG	3	6	3910	3915	50 %	0 %	50 %	0 %	409249102
79	NT_187078	TTA	2	6	3916	3921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249102
80	NT_187078	AAC	2	6	3951	3956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249102
81	NT_187078	CAC	2	6	4029	4034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249103
82	NT_187078	GAA	2	6	4132	4137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249103
83	NT_187078	GCA	2	6	4140	4145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249103
84	NT_187078	GCC	2	6	4150	4155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249103
85	NT_187078	CGA	2	6	4191	4196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249103
86	NT_187078	TGG	2	6	4208	4213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249103
87	NT_187078	GATA	2	8	4308	4315	50 %	25 %	25 %	0 %	409249103
88	NT_187078	TTG	2	6	4381	4386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249103
89	NT_187078	GAT	2	6	4423	4428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249103
90	NT_187078	TTG	2	6	4514	4519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249103
91	NT_187078	T	6	6	4543	4548	0 %	100 %	0 %	0 %	409249103
92	NT_187078	GAT	2	6	4627	4632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249103
93	NT_187078	TCG	2	6	4707	4712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249103
94	NT_187078	GAC	2	6	4846	4851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249103
95	NT_187078	GCTGG	2	10	4857	4866	0 %	20 %	60 %	20 %	409249103
96	NT_187078	GCC	2	6	4868	4873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249103
97	NT_187078	TTC	2	6	4888	4893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249103
98	NT_187078	GC	3	6	4918	4923	0 %	0 %	50 %	50 %	409249103
99	NT_187078	TGG	2	6	4928	4933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249103
100	NT_187078	GC	4	8	4958	4965	0 %	0 %	50 %	50 %	409249103
101	NT_187078	TTG	2	6	5027	5032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249103
102	NT_187078	CGC	2	6	5105	5110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249103
103	NT_187078	CGG	2	6	5129	5134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249103
104	NT_187078	GGT	2	6	5139	5144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249103
105	NT_187078	T	6	6	5173	5178	0 %	100 %	0 %	0 %	409249103
106	NT_187078	CTG	2	6	5182	5187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249103
107	NT_187078	GGA	2	6	5196	5201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249103
108	NT_187078	GGC	2	6	5313	5318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249103
109	NT_187078	A	6	6	5323	5328	100 %	0 %	0 %	0 %	409249103
110	NT_187078	TCT	2	6	5332	5337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249103
111	NT_187078	TGA	2	6	5381	5386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249103
112	NT_187078	TTC	2	6	5440	5445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249103
113	NT_187078	T	6	6	5448	5453	0 %	100 %	0 %	0 %	409249103
114	NT_187078	CAT	2	6	5532	5537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249104
115	NT_187078	CAG	2	6	5560	5565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249104
116	NT_187078	CGC	2	6	5566	5571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249104
117	NT_187078	TAA	2	6	5583	5588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249104
118	NT_187078	CG	3	6	5620	5625	0 %	0 %	50 %	50 %	409249104
119	NT_187078	CTC	2	6	5635	5640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249104
120	NT_187078	TGC	2	6	5726	5731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249104
121	NT_187078	GTC	2	6	5732	5737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249104
122	NT_187078	TGA	2	6	5757	5762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249104
123	NT_187078	CAG	2	6	5788	5793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249104
124	NT_187078	CAG	2	6	5806	5811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249104
125	NT_187078	ATT	2	6	5899	5904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249104
126	NT_187078	TGG	2	6	5967	5972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249104
127	NT_187078	GGT	2	6	6001	6006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249104
128	NT_187078	ATG	2	6	6017	6022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249104
129	NT_187078	GGC	2	6	6130	6135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249104
130	NT_187078	GCG	2	6	6143	6148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249104
131	NT_187078	CGC	2	6	6243	6248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249104
132	NT_187078	GC	4	8	6384	6391	0 %	0 %	50 %	50 %	409249104
133	NT_187078	TCA	2	6	6521	6526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249104
134	NT_187078	CGC	2	6	6549	6554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249104
135	NT_187078	GCGTA	2	10	6597	6606	20 %	20 %	40 %	20 %	409249104
136	NT_187078	C	6	6	6635	6640	0 %	0 %	0 %	100 %	409249104
137	NT_187078	TGC	2	6	6668	6673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249104
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269	NT_187078	TAA	2	6	12597	12602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249110
270	NT_187078	AGA	2	6	12614	12619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249110
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273	NT_187078	TCT	2	6	12693	12698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249110
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275	NT_187078	TGT	2	6	12814	12819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
276	NT_187078	TTG	2	6	12877	12882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
277	NT_187078	TGC	2	6	12892	12897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
278	NT_187078	AAT	2	6	12959	12964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NT_187078	TGT	2	6	12981	12986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
280	NT_187078	TGG	2	6	13065	13070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
281	NT_187078	GGC	2	6	13136	13141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
282	NT_187078	GCG	2	6	13187	13192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249111
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371	NT_187078	ATT	2	6	17475	17480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
372	NT_187078	TACGGG	2	12	17534	17545	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409249115
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387	NT_187078	GC	3	6	18037	18042	0 %	0 %	50 %	50 %	409249115
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393	NT_187078	GCA	2	6	18254	18259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249115
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395	NT_187078	CGT	2	6	18284	18289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249115
396	NT_187078	CAG	2	6	18324	18329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249115
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